Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprqP0C5E4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms