Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01853 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01853 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01853 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01853 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01853 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01853 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01853 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01853 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01853 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01853 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01853 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01853 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01853 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01853 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01853 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01853 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01853 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01853 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01853 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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