Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01644 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01644 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01644 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01644 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01644 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01644 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01644 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01644 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01644 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01644 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01644 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01644 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01644 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01644 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01644 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01644 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01644 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01644 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01644 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01644 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01644 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01644 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01644 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01644 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01644 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01644 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01644 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01644 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01644 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01644 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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