Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp4O70480 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp4O70480 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms