Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Lnx1O70263 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lnx1O70263 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms