Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkbO70126 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkbO70126 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkbO70126 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkbO70126 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkbO70126 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms