Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Rdh16O54909 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Rdh16O54909 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Rdh16O54909 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Rdh16O54909 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Rdh16O54909 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Rdh16O54909 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Rdh16O54909 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rdh16O54909 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms