Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
DffaO54786 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DffaO54786 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DffaO54786 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
DffaO54786 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DffaO54786 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DffaO54786 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
DffaO54786 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DffaO54786 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DffaO54786 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffaO54786 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffaO54786 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffaO54786 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffaO54786 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffaO54786 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffaO54786 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffaO54786 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffaO54786 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffaO54786 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffaO54786 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffaO54786 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DffaO54786 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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