Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek2O35942 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms