Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl25O35903 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms