Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sp100O35892 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Sp100O35892 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Sp100O35892 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Sp100O35892 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Sp100O35892 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Sp100O35892 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sp100O35892 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Sp100O35892 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Sp100O35892 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Sp100O35892 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Sp100O35892 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sp100O35892 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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