Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timm44O35857 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timm44O35857 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timm44O35857 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timm44O35857 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timm44O35857 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms