Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms