Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kpna4O35343 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms