Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms