Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ArxO35085 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ArxO35085 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ArxO35085 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ArxO35085 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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ArxO35085 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ArxO35085 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ArxO35085 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms