Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gcm2O09102 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gcm2O09102 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms