Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp2O08999 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ltbp2O08999 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ltbp2O08999 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ltbp2O08999 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ltbp2O08999 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ltbp2O08999 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ltbp2O08999 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ltbp2O08999 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ltbp2O08999 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ltbp2O08999 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ltbp2O08999 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ltbp2O08999 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ltbp2O08999 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms