Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms