Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Efna3O08545 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Efna3O08545 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Efna3O08545 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Efna3O08545 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms