Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21310J3QQ23 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21310J3QQ23 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms