Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2056J3QQ02 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms