Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms