Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm11236J3QMS7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm11236J3QMS7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm11236J3QMS7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm11236J3QMS7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm11236J3QMS7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm11236J3QMS7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm11236J3QMS7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm11236J3QMS7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm11236J3QMS7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm11236J3QMS7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm11236J3QMS7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm11236J3QMS7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm11236J3QMS7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm11236J3QMS7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm11236J3QMS7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm11236J3QMS7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Gm11236J3QMS7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm11236J3QMS7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm11236J3QMS7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm11236J3QMS7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm11236J3QMS7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm11236J3QMS7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm11236J3QMS7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm11236J3QMS7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm11236J3QMS7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm11236J3QMS7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm11236J3QMS7 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm11236J3QMS7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm11236J3QMS7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm11236J3QMS7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm11236J3QMS7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm11236J3QMS7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm11236J3QMS7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm11236J3QMS7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm11236J3QMS7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm11236J3QMS7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm11236J3QMS7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm11236J3QMS7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm11236J3QMS7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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