Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lipo1J3QME6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms