Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms