Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4bG5E8Z2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms