Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Atp2b1G5E829 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Atp2b1G5E829 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Atp2b1G5E829 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Atp2b1G5E829 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Atp2b1G5E829 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Atp2b1G5E829 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Atp2b1G5E829 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Atp2b1G5E829 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Atp2b1G5E829 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Atp2b1G5E829 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b1G5E829 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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