Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef1G3X9K3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms