Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm9972E9Q053 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms