Protein–RNA interactions for Protein: E9PZP8

Herc1, HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1E9PZP8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Herc1E9PZP8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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