Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sbf2E9PXF8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms