Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3002E9PW72 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms