Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms