Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce3B5KM66 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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