Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PtprbB2RU80 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PtprbB2RU80 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PtprbB2RU80 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms