Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms