Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Uhrf1bp1B2KF50 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms