Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Prr16A3KMN5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Prr16A3KMN5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Prr16A3KMN5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms