Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm6880A3KG45 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm6880A3KG45 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm6880A3KG45 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm6880A3KG45 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm6880A3KG45 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm6880A3KG45 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gm6880A3KG45 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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