Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms