Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Scn1aA2APX8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Scn1aA2APX8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Scn1aA2APX8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Scn1aA2APX8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Scn1aA2APX8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Scn1aA2APX8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Scn1aA2APX8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Scn1aA2APX8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn1aA2APX8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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