Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syndig1A2ANU3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms