Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmpd1A2AKB4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms