Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms