Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34dA2AGU5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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