Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Pramef6A2A8M8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pramef6A2A8M8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms