Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calcoco2A2A6M5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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