Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top3bQ9Z321 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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