Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lgr5Q9Z1P4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms